水产科学

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD扩展版

国内刊号:21-1110/S

国际刊号:1003-1111

水产科学杂志2021年第5期:黑鲷钙调磷酸酶B同源蛋白2(CHP2)基因克隆及表达差异

发布日期:

作者:陈淑吟, 张志勇, 孙瑞健, 贾超峰, 孟乾, 祝斐, 张志伟, 吴国均

单位:江苏省海洋水产研究所,江苏 南通 226007

关键词:黑鲷,钙调磷酸酶B同源蛋白2基因,基因克隆,mRNA表达

基金:江苏省农业重大新品种创制项目(PZC201744);江苏省农业科技自主创新资金资助项目(CX(17)2021);江苏省科技项目(BK20181202).

钙调磷酸酶B同源蛋白2(CHP2)为参与细胞内pH及细胞增殖调控的关键因子。用RACE末端PCR方法得到黑鲷CHP2(AsCHP2)基因全长cDNA,并利用生物信息学方法分析该基因的序列特征与同源性;同时利用实时荧光定量PCR方法检测AsCHP2的mRNA在黑鲷整体仔鱼,90 d、180 d黑鲷,杂交F2(真鲷♂×黑鲷♀)及回交F1(黑鲷♂×杂交F1♀)的脑、心脏、肌肉、肝脏和性腺等组织中的表达。研究结果表明:(1)AsCHP2 cDNA序列全长1722 bp,5′-非编码区(UTR)长度69 bp,3′- UTR长度1069 bp,开放阅读框长度为585 bp,编码194个氨基酸;其结构域包含2个EF-hand结构及1个核输出信号;其蛋白分子质量为21.87 ku,理论等电点为4.89;同源建模获得了CHP2的二级与三维结构。AsCHP2基因的核苷酸序列与其他鱼类的相似性为86%~81%,编码的氨基酸序列与其他鱼类的相似性为80%~72%。邻接系统树显示了黑鲷CHP2氨基酸序列与其他鱼类的进化关系。序列比对与结构分析表明,AsCHP2基因具有典型的CHP2基因结构。(2)AsCHP2的mRNA在黑鲷的仔鱼期(5~35 d)及大规格个体的脑、肝脏及肌肉组织中均有表达,在90 d个体各组织中的表达量均高于在180 d个体各组织中的表达量;在180 d黑鲷、杂交F2及回交F1的个体中,基因在脑、肝脏、肌肉及性腺等不同组织中均有表达,且均在心脏中高表达、在性腺中低表达。这些结果显示,CHP2基因在海水鱼类的生长、发育过程中发挥功能。

来源:2021年第5期

《水产科学》期刊编辑部

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