水产科学

作者：宁梓健, 寇诗瑀, 包杰, 姜宏波

单位：沈阳农业大学 畜牧兽医学院,辽宁 沈阳 110866

关键词：中华绒螯蟹微孢子虫,分泌蛋白,基因组,信号肽,基序

基金：财政部和农业农村部现代农业产业技术体系项目(CARS-48);辽宁省教育厅科学研究经费资助项目(LSNQN202002);辽宁省科技特派团项目(2020JH5/10400147,2020JH5/10400115);辽宁省重点研发项目(2019JH/10200006,2019JH8/10200018).

本试验运行真核生物分泌蛋白预测流程EuSecPred 2.0在中华绒螯蟹微孢子虫全基因组范围内预测分泌蛋白,同时分析分泌蛋白的序列特征,注释功能。结果表明,分泌蛋白序列长度大多为30~300 aa;信号肽长度为11~23 aa;信号肽切割位点处主要由疏水性氨基酸组成;对预测所得蛋白质功能的注释,发现了多种关键蛋白,如血凝素酯酶、甲基转移酶EZH1和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶等。基序分析发现,信号肽中存在基序S[NS]N[TI][FI]VI[IGD][RG]VRC。预测获得的这些重要分泌蛋白与中华绒螯蟹微孢子虫侵染宿主、调控宿主细胞周期及免疫反应等生理活动相关,可为筛选致病相关候选因子和探究其侵染机理提供重要依据。

来源：2022年第2期

《水产科学》期刊编辑部

查看水产科学杂志2022年第2期