水产科学

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国内刊号:21-1110/S

国际刊号:1003-1111

水产科学杂志2022年第2期:不同来源杀鲑气单胞菌毒力因子的比较基因组学研究

发布日期:

作者:郝婧薇, 王艺, 贺凤兰, 傅松哲, 申旭东, 刘鹰

单位:1.大连海洋大学 海洋科技与环境学院,辽宁 大连 116023; 2.大连海洋大学,设施渔业教育部重点实验室,辽宁 大连 116023; 3.河北科技师范学院 海洋资源与环境学院,河北 秦皇岛 066000; 4.南昌市疾病预防控制中心,江西 南昌 330038; 5.中国水产科学研究院 营口增殖实验站,辽宁 营口 115004

关键词:杀鲑气单胞菌,耐药基因,毒力基因,插入序列,系统发育

基金:国家重点研发计划项目(2017YFD0701700);国家自然科学基金资助项目(31672673,81903372).

自凡纳滨对虾养殖水体中分离得到1株杀鲑气单胞菌YK-48,为确定YK-48与在鞍山养殖场金鱼体内分离出来的AS.17和烟台大西洋鲑体内分离出来的S68和S121等不同来源的杀鲑气单胞菌的毒力基因特征之间是否存在差异,对YK-48的形态、生理生化特征和药物敏感性进行分析,随后进行全基因组测序,对4株杀鲑气单胞菌进行基因组基本特征分析、毒力基因注释和耐药基因分析。通过系统发育分析发现,YK-48与AS.17聚类在一起,说明其为相同亚型中的同一克隆群。药敏试验结果显示,YK-48对利福平、杆菌肽、万古霉素和青霉素耐药。对毒力基因进行分析,菌株AS.17和YK-48的毒力基因结果基本一致;与S68和S121相比,抗吞噬作用和免疫调节相关表达的基因为AS.17和YK-48特有的基因;通过细菌黏附试验,验证了菌株YK-48不含黏附相关基因。通过基因组学对3种来源杀鲑气单胞菌进行比较,可为解析不同来源杀鲑气单胞菌毒力基因特征提供参考,并为其防控积累数据。

来源:2022年第2期

《水产科学》期刊编辑部

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