水产科学

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国内刊号:21-1110/S

国际刊号:1003-1111

水产科学杂志2022年第4期:DNA条形码在海蜇食物组成鉴定中的应用

发布日期:

作者:李玉龙, 鲍相渤, 高祥刚, 段妍, 王彬, 董婧, 李云峰

单位:辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省分子生物学重点实验室,辽宁 大连 116023

关键词:海蜇,DNA条形码,COⅠ,ITS-5.8S rDNA

基金:辽宁省科学事业公益研究基金资助项目(20180015);大连市高层次人才创新支持计划项目(2019RQ064);辽宁省海洋渔业厅项目(201834);国家海洋水产种质资源库项目(DKA30470).

对海蜇的食性进行研究有助于查明其饵料来源及其在食物网中的功能地位,而全面准确地获取其食物种类信息是关键。由于传统镜检方法具有局限性,目前对海蜇具体的摄食种类和食物结构尚缺乏充分的了解。DNA条形码技术的发展给海蜇食性研究带来了机遇。笔者以线粒体COⅠ和ITS-5.8S rDNA这两种基因片段为DNA条形码标记,对辽东湾近海海蜇的现场食物组成进行分析,比较两种分子标记作为海蜇食性鉴定条形码的适用性和潜力,评估这两个DNA条形码用于检测海蜇食物组成的应用前景。研究结果显示:基于COⅠ基因通用引物扩增海蜇现场样品所构建的克隆文库共获取36个有效序列,来源于4个物种;而基于ITS-5.8S rDNA通用引物扩增共得到30个有效序列,来源于10个物种。利用DNA条形码技术能检测到鱼卵、仔稚鱼或成鱼碎屑、贝类浮游幼体等海蜇的潜在食物种类。研究结果表明,以传统测序为基础的DNA条形码技术由于测序通量低,在研究海蜇这一广食性种类的食物谱时可能具有较大的局限性。研究结果可为深入研究海蜇乃至水母的食物组成提供参考。

来源:2022年第4期

《水产科学》期刊编辑部

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