水产科学

作者：邹杰, 彭慧婧, 郑德斌, 张守都

单位：1.广西科学院,广西 南宁 530000;2.广西海洋研究所有限责任公司,广西 北海 536000;3.天津渤海水产研究所,天津 300457;4.山东省海洋科学研究院,山东 青岛 266000

关键词：合浦珠母贝,杂交,单核苷酸多态,遗传分化,长纯合片段

基金：广西创新驱动发展专项(桂科AA19254008);广西重点研发项目(桂科AB18294001);北海市科技计划项目(北科合201777036).

为探索广西合浦珠母贝群体内杂交组合方式,分别从北海野生群体(F1)、选育群体(F4)和养殖群体中随机挑选2龄种贝样本15个,进行简化基因组测序,通过单核苷酸多态标记解析3个群体的遗传关系。研究结果显示,获得超过585 000个单核苷酸多态标记,野生群体、选育群体和养殖群体的观测杂合度分别为0.1975、0.1679和0.1783,期望杂合度分别为0.2545、0.2469和0.2732,平均近交系数分别为0.2075、0.3449和0.3465,多态信息含量分别为0.2032、0.2089和0.2241,选育群体近交系数与养殖群体相近,野生群体和养殖群体的群体遗传多态高于选育群体。系统进化树和主成分分析显示,选育群体与养殖群体部分样品亲缘关系较近。选育群体和养殖群体之间的遗传分化指数最低,部分亲本同源的可能性较大;野生群体、选育群体和养殖群体的平均长纯合片段数分别为59.1、49.5个和56.6个,长纯合片段平均长度分别为0.312、0.313 Mb和0.311 Mb,平均单核苷酸多态标记含量分别为59、50和73,近交系数FROH分别为0.0149~0.0240、0.0159~0.0201和0.0170~0.0246,反映3个群体的真实近交水平较低;野生群体、选育群体和养殖群体的整个染色体内连锁不平衡衰减距离分别为0.4、0.4 kb和0.2 kb(r2=0.2),衰减速度为养殖群体>野生群体>选育群体,选育群体衰减速度最慢,可能与人工选育有关。以上结果表明,广西合浦珠母贝可采用野生群体×选育群体或野生群体×养殖群体的杂交组合方式开展群体内杂交。本研究结果可为广西合浦珠母贝育种中的亲本选择提供参考。

来源：2023年第3期

《水产科学》期刊编辑部

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