水产科学

作者：刘思嘉, 祁得林, 祁洪芳, 韩步鹰, 牛依萌, 赵凯, 田菲

单位：1.中国科学院 西北高原生物研究所,青海省动物生态基因组学重点实验室,青海 西宁 810008;2.青海大学,省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海 西宁 810016;3.青海湖裸鲤救护中心,青海湖裸鲤繁育与保护重点实验室,青海 西宁 810016

关键词：青海湖裸鲤,低温适应,实时荧光定量PCR,内参基因

基金：中国科学院“西部青年学者B类”人才培养计划项目;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室开放基金资助项目(2019-KF-005);青海省青年自然科学基金资助项目(2021-ZJ-949Q).

为探明青海湖裸鲤候选内参基因在低温环境下的表达稳定性,根据RNA-seq定量结果筛选表达稳定的候选内参基因,利用实时荧光定量PCR检测候选基因在0 ℃和17 ℃下,脑、肝胰脏、肌肉组织中的表达量,并通过GeNorm、Norm Finder和Best Keeper 3种分析程序分析其表达稳定性,筛选出理想的内参基因。结果显示:根据RNA-seq定量结果,共筛选获得脱水酶(Abhd18)基因、微球蛋白(B2m)基因、延伸蛋白A(Eloa)基因、DAZ相关蛋白2(Dazap2)基因、肌动蛋白(Actb)基因、磷酸甘油醛脱氢酶(Gapdh)基因、BCL细胞死亡激动因子(Bad)基因和脂肪酸结合蛋白3(Fabp3)基因等8个候选基因;对上述基因的表达稳定性进行分析,发现表达最稳定的是B2m和Eloa基因,表达最不稳定的是Fabp3基因;利用B2m和Eloa基因作为双内参基因对4个脂肪酸代谢相关基因在0 ℃和17 ℃脑、肝胰脏、肌肉组织中的表达量进行校正,其相对表达比值与RNA-seq结果高度正相关。研究结果可为高原鱼类极端环境适应的研究提供候选内参基因。

来源：2023年第3期

《水产科学》期刊编辑部

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