水产科学

作者：施金谷, 武霞, 黄光华, 杨慧赞, 梁怡, 吕敏, 曾兰, 胡大胜, 黄立斌, 王瑞

单位：1.广西水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西 南宁 530021;2.广西水产技术推广站,广西 南宁 530022;3.广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林 541006

关键词：16S rRNA,罗氏沼虾,肠道菌群,菌群功能

基金：广西重点研发项目(桂科AB1850016,桂科AB19245033);广西科技重大专项(桂科AA17204095-5).

相同养殖条件下,养殖5个种群的罗氏沼虾,选取同批次孵化20 d的罗氏沼虾幼体,采用16S rRNA高通量测序技术对罗氏沼虾缅甸种群、斯里兰卡种群、越南种群、孟加拉种群和自有品种1种群幼虾的肠道菌群进行分析。结果显示,罗氏沼虾缅甸种群、斯里兰卡种群、越南种群、孟加拉种群和自有品种1种群幼虾5个组共有的运算分类单元为256个,每组特有的运算分类单元分别为131、247、231、144、184个。孟加拉种群幼虾的肠道菌群物种丰富度最高,越南种群幼虾的肠道菌群物种多样性最高。5个组的优势菌群在门、科水平上都相似,都为变形菌门、拟杆菌门和厚壁菌门,但其丰度及其他菌群的组成存在差异,斯里兰卡种群肠道菌群中厚壁菌门的丰度大于拟杆菌门,与其他4组菌群不同。5个组的菌群功能也存在共性,主要集中于新陈代谢中的碳水化合物代谢、氨基酸代谢、维生素代谢等方面。试验结果表明,罗氏沼虾不同种群幼体的肠道菌群在结构组成、丰度、代谢功能等方面存在一定的共性。本研究结果可为进一步研究不同种群罗氏沼虾的生长发育机制打下基础。

来源：2023年第4期

《水产科学》期刊编辑部

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