水产科学

作者：倪伟琳, 刘丹, 高强, 晁燕, 张存芳, 寇若彬, 祁得林, 聂苗苗

单位：1.青海大学,省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海 西宁 810016; 2.青海大学农牧学院 动物科学系,青海 西宁 810016; 3.青海大学 生态环境工程学院,青海 西宁 810016

关键词：花斑裸鲤,SIRT基因家族,基因特征与表达,低温适应

基金：国家自然科学基金资助项目(31960127);青海省自然科学基金资助项目(2020-ZJ-907);省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室自主课题项目(2020-ZZ-15);青海大学青年科研基金资助项目(2022-QNY-1).

花斑裸鲤是裂腹鱼亚科的代表物种之一,能够很好地适应青藏高原寒冷的环境。为探究sirtuins(SIRT)基因家族在花斑裸鲤低温适应中的作用,笔者对SIRT基因家族的7个基因进行了生物信息学分析和基因表达研究。结果显示,花斑裸鲤SIRT基因家族的长度差异较大,序列最长的是SIRT1基因(22 885 bp),最短的是SIRT4基因(3660 bp),包含蛋白质编码区,编码304至691个氨基酸不等。通过保守结构域和基序分析发现,花斑裸鲤SIRT基因均具有Sir2保守结构域和基序,包括GAGxSx、xxPxxR、PxxxH和QNxDxLx。氨基酸理化性质预测结果表明,花斑裸鲤SIRT蛋白均为亲水性蛋白,除SIRT4之外,均是不稳定蛋白。亚细胞定位预测结果显示,SIRT蛋白主要分布于细胞质和细胞核中。通过预测蛋白质相互作用发现,SIRTs与SOD2、CAT、PPARGC1α、p53、FOXO1a和FOXO1b具有相互作用。进一步对SIRT基因在低温适应的花斑裸鲤的肝脏、脑和肌肉组织中表达进行分析,结果显示,低温下,SIRT2、SIRT4和SIRT7基因在肝脏和脑中表达显著上调,SIRT2~4、SIRT6和SIRT7基因在肌肉中表达显著上调,推测SIRT基因家族尤其是SIRT2、SIRT4和SIRT7基因在花斑裸鲤低温适应中可能具有重要作用。本试验分析了花斑裸鲤SIRT基因家族的特征,其结果可为后续SIRT基因在花斑裸鲤低温适应中功能研究提供基础。

来源：2024年第1期

《水产科学》期刊编辑部

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