水产科学

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国内刊号:21-1110/S

国际刊号:1003-1111

水产科学杂志2024年第6期:仿刺参miR-10与arhgef3序列分析及盐度胁迫下的表达模式

发布日期:

作者:勾宇晴, 魏馨, 马南行, 刘丹, 高思琪, 田燚

单位:大连海洋大学 水产与生命学院,农业农村部北方海水增养殖重点实验室,辽宁 大连 116023

关键词:仿刺参,盐度胁迫,arhgef3,miRNA-10

基金:国家重点研发计划项目(2019YFD0900505).

为探究盐度胁迫下仿刺参的响应过程,从转录组和miRNA的高通量测序结果中筛选差异表达的miR-10及对应的靶基因arhgef3,分析miR-10及靶基因arhgef3在低盐胁迫下的表达情况。分析miR-10的前体序列和成熟序列显示,miR-10能形成稳定的茎环结构,高度保守区域在29~51区间。靶基因arhgef3的开放阅读框长度为1728 bp,编码575个氨基酸,在第280~500氨基酸之间存在1个功能结构域。靶基因arhgef3的表达存在明显的组织特异性,在肠道、呼吸树和体腔细胞中表达显著高于其他组织(P<0.05)。低盐条件下,miR-10在24 h的表达量显著低于对照组0 h,在48 h时显著高于对照组0 h;在胁迫6 h组arhgef3基因的表达量显著高于对照组0 h。在体腔细胞转染miR-10抑制剂(inhibitor),试验组在24 h显著低于0 h,48 h显著高于0 h;转染miR-10模拟物(mimics)后试验组在6 h和48 h均显著高于0 h。在仿刺参体内转染miR-10抑制剂(antagomir)后的试验组arhgef3基因的表达量变化不明显,而转染miR-10模拟物(agomir)后试验组arhgef3基因的表达量在24 h内有较显著的提升。试验结果表明,arhgef3可以被盐度诱导表达,且说明盐度胁迫的响应过程中需要靶基因维持高的表达水平来适应盐度变化,更好地适应仿刺参的低盐响应过程。

来源:2024年第6期

《水产科学》期刊编辑部

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